Produkty

Produktem jest ester β-alaniny, N,N',N''-(nitrilotri-2,1-etanodiylo)tris[N-metylo-,1,1',1''-tritridecylu (powszechnie znany jako 304O13). Strukturalnie jest to ulegający jonizacji lipidoid kationowy, charakteryzujący się rdzeniem z centralnej aminy trzeciorzędowej (nitrylotri-2,1-etanodiyl) połączonym trzema ramionami z jednostkami N-metylo-β-alaniny, z których każda kończy się długim, nasyconym łańcuchem tridecylowym (C13) alkilowym. Ta unikalna architektura molekularna została szczegółowo zaprojektowana pod kątem jej funkcji: centralna amina zapewnia jonizację zależną od pH (kationową przy niskim pH, neutralną przy fizjologicznym pH), wiązania amidowe zapewniają biodegradowalność, a trzy hydrofobowe ogony napędzają samoorganizację w nanocząsteczki lipidowe (LNP).

C13-112-tetra-ogon (CAS 1381861-92-2) to podatna na jonizację cząsteczka lipidu kationowego charakteryzująca się unikalną architekturą molekularną, która łączy polarną grupę główną aminoalkoholową, cztery hydrofobowe ogony węgla-13 i łącznik PEG2. Lipid zawiera rdzeń centralnej aminy trzeciorzędowej, z którego rozciągają się cztery łańcuchy tridecylowe (C13), każdy kończący się pierwszorzędową grupą hydroksylową. Strukturalnie, tetraogon C13-112 składa się z dwóch jednostek aminoalkoholu połączonych za pomocą przerywnika PEG2 (glikolu dietylenowego), co daje symetryczną konfigurację z wieloma ogonami, która maksymalizuje objętość hydrofobową, zachowując jednocześnie amfifilowość dla skutecznego tworzenia nanocząstek lipidowych (LNP).

1-[2,3-Bis[(9Z,12Z)-oktadeka-9,12-dien-1-yloksy]propylo]pirolidyna, znana również jako A-066, jest lipidem kationowym zawierającym pirolidynową grupę główną przyłączoną do szkieletu glicerolowego, który jest di-eteryfikowany dwoma ogonami węglowodorowymi linoleilu (C18:2, Δ9,12). Strukturalnie cząsteczka zawiera centralne chiralne rusztowanie glicerolowe z dwoma łańcuchami nienasyconych alkoholi tłuszczowych (każdy zawierający dwa wiązania podwójne cis) połączone wiązaniami eterowymi i zakończone trzeciorzędową aminą pirolidyny. Obecność pirolidynowej grupy czołowej odróżnia 1-[2,3-Bis[(9Z,12Z)-oktadeka-9,12-dien-1-yloksy]propylo]pirolidynę od strukturalnie pokrewnej DODMA, która zawiera grupę dimetyloaminową.

Produktem jest 2'-F-Ac-dC Fosforamidyt (5'-O-(4,4'-dimetoksytritylo)-2'-fluoro-2'-deoksycytydyno-3'-O-[(2-cyjanoetylo)-(N,N-diizopropylo)]-fosforamidyt). Jako wyspecjalizowany monomer amidofosforynowy, jego struktura rdzenia obejmuje ugrupowanie cukrowe 2'-deoksycytydyny z atomem fluoru w pozycji 2' i grupą zabezpieczającą acetyl (Ac) na zasadzie cytozyny. Ta unikalna modyfikacja 2'-fluoro znacząco wpływa na konformację fałdki cukru, blokując pierścień rybozy w konformację C3'-endo (podobną do RNA). Ta wstępnie zorganizowana struktura radykalnie zwiększa oporność na nukleazy powstałego oligonukleotydu i zwiększa jego powinowactwo wiązania z komplementarnymi celami RNA. Dlatego 2'-F-Ac-dC Fosforoamidyt nie jest tylko elementem konstrukcyjnym; jest kluczem do wytwarzania stabilizowanych chemicznie oligonukleotydów antysensownych o wysokim powinowactwie (ASO), siRNA i aptamerów.

2'-F-dU Fosforamidyt (znany również jako DMT-2′-F-dU Fosforamidyt, CAS 146954-75-8) to chemicznie modyfikowany monomer amidofosforyny deoksyurydyny zawierający podstawienie 2′-fluoro (2′-F) na cukrze dezoksyrybozy, substancję zabezpieczającą 5′-O-dimetoksytrityl (DMT) grupę i β-cyjanoetylo (CE)fosforoamidyn w pozycji 3′. Zasada urydynowa nie zawiera żadnej egzocyklicznej grupy zabezpieczającej aminę (w przeciwieństwie do cytydyny czy adenozyny), co upraszcza syntezę i odbezpieczanie oligonukleotydów zawierających tę modyfikację. Modyfikacja 2′-fluoro jest jedną z najpotężniejszych modyfikacji chemicznych zwiększających oporność na nukleazy i stabilność termiczną w lekach oligonukleotydowych. Wysoce elektroujemny atom fluoru w pozycji 2′ blokuje cukier w konformację C3′-endo (podobną do RNA), która wstępnie organizuje szkielet oligonukleotydowy w celu ścisłego wiązania z komplementarnymi celami RNA. 2'-F-dU Fosforamidyn jest szeroko stosowany w syntezie siRNA, oligonukleotydów antysensownych (ASO) i aptamerów, szczególnie tam, gdzie potrzebna jest zasada podobna do tyminy, ale o zwiększonym powinowactwie wiązania z adenozyną.

1,2-Dioleilo-3-trimetyloamoniopropan (sól chlorkowa), powszechnie określany jako chlorek DOTAP, jest lipidem kationowym powszechnie uznawanym za jego rolę w dostarczaniu kwasu nukleinowego. Strukturalnie cząsteczka zawiera czwartorzędową grupę amoniową, która niesie trwały ładunek dodatni, dwa 18-węglowe łańcuchy oleoilowe (C18:1), każdy zawierający jedno wiązanie podwójne cis, oraz przeciwjon chlorkowy, który równoważy całkowity ładunek. Ogony nienasyconych kwasów tłuszczowych powodują załamania łańcuchów acylowych, zwiększając płynność błony i promując fuzję liposomów z błonami komórkowymi. Postać chlorkowa 1,2-dioleilo-3-trimetyloamoniopropanu (sól chlorkowa) jest preferowaną formulacją do zastosowań biologicznych, ponieważ przeciwjon chlorkowy zapewnia rozpuszczalność w wodzie i zgodność z warunkami fizjologicznymi - w przeciwieństwie do słabo rozpuszczalnych postaci soli jodkowych. To połączenie trwałego ładunku kationowego i elastycznych nienasyconych ogonów sprawia, że ​​1,2-dioleilo-3-trimetyloamoniopropan (sól chlorkowa) jest wyjątkowo skutecznym elementem budulcowym do formułowania liposomów i nanocząstek lipidowych (LNP) do zastosowań w dostarczaniu genów.