5'-O-(4,4'-Dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforynMidyt

5'-O-(4,4'-dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyt jest standardowym monomerem do wprowadzania reszt 5-metylo-2′-deoksycytydyny do syntetycznego DNA i oligonukleotydów antysensownych. Grupa N4-benzoilowa chroni egzocykliczną aminę zasady cytozyny, zapobiegając reakcjom rozgałęziania podczas syntezy w fazie stałej. Grupa 5-metylowa w pierścieniu cytozyny zwiększa stabilność termiczną dupleksów utworzonych z komplementarnego DNA lub RNA (ΔTm ≈ +0,5–1,0°C na modyfikację) i, co ważne, zmniejsza potencjał immunostymulujący motywów CpG stosowanych w szczepionkach antysensownych lub opartych na CpG. 5'-O-(4,4'-Dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyt jest w pełni kompatybilny ze standardowymi cyklami syntezy DNA (czas sprzęgania 2–3 minuty, aktywator taki jak tetrazol lub DCI) i standardowymi warunkami odbezpieczania (stężony NH3, 55°C, 8–16 godzin). 5'-O-(4,4'-dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyt jest również kluczowym związkiem pośrednim w syntezie oligonukleotydów zawierających zablokowany kwas nukleinowy (LNA) w połączeniu z innymi modyfikowanymi monomerami. Ten amidofosforyn jest często stosowany w produkcji leków antysensownych zatwierdzonych przez FDA oraz w zastosowaniach badawczych obejmujących regulację epigenetyczną i analizę metylacji DNA.

Parametry produktu

Zapewnienie jakości w Cosperpharm

Każda partia przechodzi:

● Chromatografia gazowa (GC) – czystość ≥97,0%

● Miareczkowanie niewodne – czystość ≥97,0%

● Współczynnik załamania światła – analiza konfirmacyjna

● ¹H NMR – weryfikacja strukturalna

● Wygląd – bezbarwna, jasnożółta do jasnopomarańczowej, klarowna ciecz

Do każdej przesyłki dołączone są kompleksowe certyfikaty COA, karty charakterystyki (z pełnymi informacjami GHS) i świadectwo pochodzenia.

Warunki przechowywania

Przechowywać 5'-O-(4,4'-dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyt w szczelnie zamkniętym pojemniku w atmosferze obojętnej (azot lub argon) w temperaturze –20°C w celu długotrwałego przechowywania. Krótkoterminowe przechowywanie (do 3 miesięcy) w temperaturze 2–8°C w warunkach osuszania może być dopuszczalne, ale nie jest zalecane przez dłuższy okres. Przechowywać pojemnik w suchym miejscu, chronić przed światłem i silnymi utleniaczami i kwasami. Mieszanka jest bardzo wrażliwa na wilgoć; otwierać tylko w warunkach bezwodnych (w komorze rękawicowej lub przy przedmuchaniu argonem). Po otwarciu niezużyty materiał umieścić bezpośrednio w atmosferze argonu w temperaturze –20°C.

Okres ważności: 2–3 lata przy przechowywaniu w temperaturze –20°C w zamkniętym, oczyszczonym obojętnie pojemniku ze środkiem suszącym.

Środki ostrożności podczas postępowania: Stosować pod wyciągiem. Nosić rękawice nitrylowe, okulary ochronne i fartuch laboratoryjny. Unikaj wytwarzania pyłu. Umyć ręce po użyciu. Pełne informacje dotyczące bezpieczeństwa można znaleźć w karcie charakterystyki.

Zalety produktu

1. 5-metylocytozyna zapewniająca zwiększoną stabilność dupleksu i odporność na nukleazy

Grupa 5-metylowa w zasadzie cytozyny zwiększa temperaturę topnienia (Tm) dupleksów DNA/DNA i DNA/RNA o około 0,5–1,0°C na modyfikację. Ta stabilizacja termiczna jest szczególnie cenna w przypadku oligonukleotydów antysensownych, gdzie wyższe powinowactwo wiązania przekłada się na lepszą siłę działania i zmniejszoną wymaganą dawkę. Grupa metylowa nadaje również zwiększoną odporność na niektóre nukleazy.

2. Zmniejszona immunostymulacja motywów CpG

Niemetylowane dinukleotydy CpG są rozpoznawane przez receptor Toll-podobny 9 (TLR9) w ludzkich komórkach odpornościowych, co prowadzi do niepożądanych efektów immunostymulujących. Włączenie 5-metylocytozyny do motywów CpG (przekształcanie CpG w 5-meCpG) osłabia rozpoznawanie TLR9, zmniejszając uwalnianie cytokin poza celem w zastosowaniach antysensownych i siRNA. 5'-O-(4,4'-Dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyn umożliwia tę krytyczną immunomodulację.

3. Pełna zgodność ze standardową syntezą i odbezpieczeniem DNA

5'-O-(4,4'-dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforamidyt wykorzystuje ten sam schemat grup zabezpieczających co standardowy amidofosforyn 2′-deoksycytydyny (DMT przy 5′, Bz przy N4, CE przy 3′), z tą tylko różnicą, że podstawnik 5-metylowy. Dlatego nie są wymagane żadne zmiany w cyklach syntezy, roztworach aktywatorów ani warunkach odbezpieczania — działa to bezproblemowo na wszystkich standardowych syntezatorach DNA.

4. Niezbędny do badań metylacji wyspy CpG

W badaniach epigenetycznych oligonukleotydy o określonych wzorach 5-metylocytozyny wykorzystuje się jako substraty dla metylotransferaz, jako standardy do sekwencjonowania wodorosiarczynem oraz jako sondy dla białek wiążących metyl. 5'-O-(4,4'-dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyt umożliwia badaczom syntezę niestandardowych metylowanych sekwencji DNA bez metylacji enzymatycznej, co często daje niekompletne lub niejednorodne wzory.

5. Terapia oligonukleotydami antysensownymi

Kilka leków antysensownych zatwierdzonych przez FDA (np. nusinersen, inotersen) zawiera reszty 5-metylocytozyny w celu zwiększenia stabilności i zmniejszenia immunogenności. 5'-O-(4,4'-Dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloamino)fosforoamidyn jest monomerem wybieranym do wytwarzania takich środków terapeutycznych na skalę przemysłową.

Skontaktuj się z nami

Szukasz zaufanego dostawcy 5'-O-(4,4'-Dimetoksytritylo)-N4-benzoilo-2'-deoksy-5-metylocytydyno-3'-O-(O-2-cyjanoetylo-N,N-diizopropyloaMino)fosforoamidytu? Cosperpharm jest gotowy zapewnić wysokiej jakości produkt, kompleksową dokumentację i sprawne wsparcie techniczne.