Bz-rC Fosforoamidyt

Bz-rC Fosforamidyn jest podstawowym monomerem do chemicznej syntezy oligonukleotydów RNA. Grupa zabezpieczająca N4-benzoil na zasadzie cytozyny zapobiega rozgałęzianiu i kończeniu łańcucha podczas cyklu sprzęgania fosforoamidytu, podczas gdy grupa 2′-O-TBDMS chroni 2′-hydroksyl w całym łańcuchu i jest usuwana po syntezie przy użyciu odczynników na bazie fluorku, takich jak trifluorowodorek trietyloaminy (TEA·3HF). Bz-rC Fosforamidyt jest zgodny ze standardowymi protokołami syntezy RNA w zautomatyzowanych syntezatorach DNA/RNA (np. Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo), zazwyczaj przy użyciu 0,25 M roztworów aktywatora (5-etylotio-1H-tetrazol, 4,5-dicyjanoimidazol) i czasów sprzęgania 5–10 minut. Fosforoamidyt Bz-rC został szeroko sprawdzony w syntezie RNA do badań strukturalnych, oligonukleotydów antysensownych, siRNA i aptamerów. Bz-rC Fosforamidyn jest również stosowany jako wzorzec odniesienia w profilowaniu zanieczyszczeń oligonukleotydowych, ponieważ grupa benzoilowa może powodować powstawanie charakterystycznych produktów ubocznych (np. produktów N4-benzoilodepirymidynacji), które należy monitorować podczas opracowywania procesu.

Parametry produktu

Zapewnienie jakości w Cosperpharm

Każda partia przechodzi:

● Chromatografia gazowa (GC) – czystość ≥97,0%

● Miareczkowanie niewodne – czystość ≥97,0%

● Współczynnik załamania światła – analiza konfirmacyjna

● ¹H NMR – weryfikacja strukturalna

● Wygląd – bezbarwna, jasnożółta do jasnopomarańczowej, klarowna ciecz

Do każdej przesyłki dołączone są kompleksowe certyfikaty COA, karty charakterystyki (z pełnymi informacjami GHS) i świadectwo pochodzenia.

Często zadawane pytania

P1: Jaka jest różnica między fosforamidytem Bz-rC a fosforamidytem Ac-rC?

Odp.: Bz-rC Fosforamidyn wykorzystuje grupę zabezpieczającą benzoil (Bz) na egzocyklicznej aminie N4 cytozyny, podczas gdy Ac-rC wykorzystuje grupę acetylową (Ac). Grupa benzoilowa zapewnia większą ochronę przed depirymidynacją w kwaśnych warunkach usuwania DMT (3% kwas trichlorooctowy w dichlorometanie). W większości zastosowań w syntezie RNA grupa benzoilowa jest preferowana w przypadku sekwencji długich lub bogatych w deoksycytydynę.

P2: Jaki jest zalecany czas sprzęgania Bz-rC Phosphoramidite na standardowym syntezatorze?

Odp.: W standardowych warunkach syntezy RNA z 0,25 M aktywatorem (np. 5-etylotio-1H-tetrazolem lub 4,5-dicyjanoimidazolem) czas sprzęgania wynoszący 5–10 minut jest typowy dla fosforoamidytu Bz-rC. W przypadku dłuższych oligonukleotydów (>40-merów) lub syntezy o dużej przepustowości optymalizacja stężenia aktywatora i czasu sprzęgania może poprawić wydajność.

Scenariusze zastosowania produktu

1. Synteza oligonukleotydów RNA

Fosforoamidyt Bz-rC to standardowy element konstrukcyjny służący do wprowadzania reszt cytydyny do syntetycznych oligonukleotydów RNA w celach badawczych, diagnostycznych i terapeutycznych.

2. Produkcja siRNA

Służy do włączania 2′-OH cytydyny do dupleksów siRNA. Grupę TBDMS usuwa się po syntezie, uzyskując w pełni natywny RNA do badań RNAi.

3. Synteza oligonukleotydów antysensownych (ASO).

ASO ukierunkowane na transkrypty RNA wymagają segmentów RNA (np. W projektach gapmerów). Bz-rC Fosforamidyt dostarcza niezbędnych reszt cytydyny z pełną odpornością na nukleazy, gdy jest pozostawiony jako 2′-OH lub zmodyfikowany.

4. Generacja aptamerów RNA

Biblioteki aptamerów i poszczególnych kandydatów na aptamery syntetyzuje się chemicznie przy użyciu fosforoamidytu Bz-rC, aby zapewnić wierność sekwencji i skalowalność.

5.Przygotowanie RNA w biologii strukturalnej

W przypadku krystalografii rentgenowskiej i badań NMR dobrze zdefiniowane sekwencje RNA muszą być syntetyzowane z dużą czystością. Bz-rC Fosforamidyt zapewnia wymaganą skuteczność sprzęgania i czystość odbezpieczania.

6. Norma referencyjna dotycząca profilowania zanieczyszczeń

Jako potencjalne zanieczyszczenie procesowe w lekach oligonukleotydowych (np. resztkowa N4-benzoilo-cytydyna, produkty niecałkowitego odbezpieczania), fosforoamidyn Bz-rC lub jego odbezpieczone pochodne służą jako standardy odniesienia w metodach HPLC i LC-MS.

Skontaktuj się z nami

Chcesz zamówić Bz-rC Fosforamidyt do swojego kolejnego projektu syntezy RNA? Zespół Cosperpharm jest do Twojej dyspozycji, aby omówić Twoje wymagania dotyczące czystości, potrzeby w zakresie dokumentacji i terminy dostaw.